2010年第二学期，广州少年宫特殊教育中心共开设30多个班级，提供免费学位585个。特殊教育中心由于服务面广，而且不设门槛，没有考试，无须选拔，学位一直供不应求， 2010年获得了市民政局福彩公益拨款后，第二学期开始便增加了大量公益性免费学位，从第一学期的14个班级，300多个免费学位，猛增至30多个班级，585个免费学位，并改变以往自主招生形式，首次按照少年宫统一的招生方式，进行网上招生。

广州少年宫的优质教育服务一直受到了社会各界的广泛认同，从1998年开始少年宫美术学校就专门为包括精神发育迟缓、唐氏综合症、肢体残缺等各种类型的特殊儿童开设了免费的美术班，在2006年为此正式成立了特殊教育中心。随着特殊儿童群体范围扩大，如今的教育服务从最初的面向智力、肢体、精神残疾的少年儿童，已拓展到包含贫困家庭子女、福利院孤儿、少教所中的贫困家庭子女、病房重症儿童等广义“特殊儿童”。

特殊教育中心教育范畴广泛，涵盖音乐、美术、计算机、心理治疗等领域，除在宫内开展美术、音乐艺术潜能课程，美术手工、器乐综合艺术、多媒体等兴趣小组课程外，还增设了包括“可移动的教室”送教服务、“性与成长”系列教育、“展翅计划”、随班就读培训等多项特色课程，孩子们可从中探索自我、表现自我。此外，每年都为本市及周边地区特殊儿童开展如“瑕之美”特殊孩子艺术节、家庭共游的“手拉手”活动、免费专家讲座与专业论坛等各特色活动，关注面延伸到特殊儿童的家长与教师。